Benoit’s comment on Jenny’s blog reminds me of the time that I was scooped, but not because my boss was carefree with data. I’ll tell you about that some other time, though, because there’s an another issue he mentions that’s recently become very pertinent.

One of the issues that crops up occasionally at the day job is retractions. Because we highlight the ‘best’ in the biological and medical literature it’s critical that we do something whenever a paper is retracted, for whatever reason. These can be very good reasons, such as conclusions becoming untenable in the light of new evidence, or irreproducible results; or because of deliberate or accidental fraud or misconduct.

There’s nothing inherently wrong with retractions: it’s part of science’s self-correcting mechanism (although we could all use a little more openness). Either way, when a paper is retracted it doesn’t just disappear: the paper itself and the retraction text remain part of the scientific record. As, indeed, do the evaluations we publish. We (i.e. f1000) need to maintain our records for the sake of posterity; we don’t simply delete evaluations of retracted papers.

Now that’s out of the way, Benoit’s comment about PIs:

the PI’s job in those cases is to talk to the competition, figure out where everyone is at [...] and make arrangements for co-publication, for example. It is no accident that a recent issue of Nature had 5 papers on the same iPS cell result, or that the cover of Nature was shared years ago by two articles on the role of lunatic fringe in chick limb development

reminds me of a story that started—at least in public—three years ago and is only just nearing closure.

Not being particularly interested in immunology, my response to the publication in Nature of three papers (by Janssen, Wiesmann and Abdul Ajees et als) reporting the structural basis for the activation of complement C3b elicited little more from me than an “ooh, that’s pretty” together with a raised eyebrow at an 80 Å shift in conformation. (I should add, here, that it’s not surprising to see three such major pieces of work published simultaneously in the same journal. As Benoit says, PIs talk—with each other and with journal editors—and publication can be delayed a little, or hurried. Which I suspect has not a little bearing on the current story.)

I would have paid it no further attention were it not for our soon-to-be departmental head, sometime in the waning of 2007, highlighting a rather intriguing Communication in Nature. Two of the authors on one of those three C3b papers, together with a couple of big guns in protein crystallography (one of whom was responsible for the gazumping I mentioned earlier), put their collective hand in the air and said, “Hang on, there’s something fishy with this third paper”:

We have reanalysed the data deposited by et al. and have discovered features that are inconsistent with the known physical properties of macromolecular structures and their diffraction data. Our findings therefore call into question the crystal structure for C3b reported by Ajees et al.

Them’s fighting words. The Communication gets a little technical (this is protein crystallography, after all), but I’ll try to explain it.
These guys decided, as you might expect, to compare the three structures. A sensible move, especially seeing as the published structures are somewhat dissimilar. Indeed, the Ajees structure is missing a huge chunk of molecule!

The coordinates do not form a connected network of molecules in the crystal lattice. The crystal structure forms layers that are separated by a large void in the c-direction (a slab of about 30–40 Å thick that spans the entire unit cell).

Sometimes it’s actually difficult to ‘find’ molecules in large, complex protein structures—if the software you use doesn’t assign electron density correctly for some reason, or the phases aren’t complete, you can fail to join the dots properly, and in the rush to publication this can be missed. So these guys took the deposited data and tried to solve the structure again, looking for the putative missing protein molecule. And they didn’t find it.

Furthermore, they noticed other physically implausible features such as no data indicating that the crystals contained water. In other words, this protein was in a vacuum; which might make theoretical physicists happy but isn’t really consistent with anything we know about biology (and Henry, you can stop the Nature abhors a vacuum joke right now).

_Killer figure_

They also found that the R factor, essentially a measure of the ‘goodness’ of a protein structure, doesn’t behave you would expect if no water was present in the calculation. Another measure of structure goodness, the B factor, looked odd too. This is a measure of how much any given atom might be expected to move; you might predict that atoms on the outside of a protein have more freedom than those inside: so the B factor should vary along the sequence. Right?

Eh. Right. In the Ajees structure, the B factors are pretty much the same across the entire length of the protein, which when you consider that the structure has vast swathes exposed to solvent (or vacuum, perhaps) is somewhat puzzling.

_somewhat puzzling_

In brief, the structure is just too good:

We think that these physically implausible features undermine the validity of the model presented by Ajees et al. and the deposited diffraction data from which it derives. Only when the experimental diffraction images are made available can the deviating C3b model be either verified or falsified.

There’s a bit of a pathetic response from Ajees and co., but basically we (as in the crystallography) waited to see what would happen next.

<eats popcorn>

What did happen next was a veritable storm on the CCP4bb mailing list, kicked off by Eleanor Dodson and titled The importance of USING our validation tools. That’s all it took for Randy Read (one of the Big Four) to weigh in with

Originally I expected that the publication of our Brief Communication in Nature would stimulate a lot of discussion on the bulletin board, but clearly it hasn’t. One reason is probably that we couldn’t be as forthright as we wished to be. For its own good reasons, Nature did not allow us to use the word “fabricated”.

That, and the necessity of waiting for Ajees et al. to respond, is probably why it took eight months for the Communication to be published. Anyway, rather than clutter up this space, I commend to you this zip archive of the CCP4bb discussion, kindly collated by Hari Jayaram.

Why am I talking about this now? Because, as reported by Iddo Friedberg, the University of Alabama at Birmingham has (finally) requested that no fewer than eleven structures, represented in nine papers, from the lab that published the apparently dodgy structure be expunged from the Protein Data Bank:

After a thorough examination of the available data, which included a re-analysis of each structure alleged to have been fabricated, the committee found a preponderance of evidence that structures 1BEF, 1CMW, 1DF9/2QID, 1G40, 1G44, 1L6L, 2OU1, 1RID, 1Y8E, 2A01, and 2HR0 were more likely than not falsified and/or fabricated and recommended that they be removed from the public record.

My spy in Sydney tells me that the Journal of Biological Chemistry has retracted one paper, and that the Journal of Molecular Biology and Acta Crystallography. He also says that Birmingham (Alabama) were slow in informing all the parties, which has delayed final actions. I also understand that journals are moving towards requesting that raw diffraction images (even if they’re as bad as Stephen’s) rather than just structure factors be deposited somewhere, so that we can all keep a big, brotherly eye on each other. And finally, “it is interesting that [the head of the lab] still claims he is innocent”.

It’s funny, that two years ago I suspected that Nature received manuscripts from Janssen and Wiesmann in reasonably quick succession, and knowing that the Ajees lab was working on the same thing poked them with a “Have you got that structure yet?”-type call. Alternatively, I thought, perhaps the Ajees group had seen presentations by the other two and realized they were about to be pipped. In either case, I reasoned, they might have had a structure almost ready, or poor crystals, and maybe they made something up.

Not good, not ethical; but possibly, just possibly, understandable. But to apparently fabricate eleven structures? That’s seriously bad, and implies a level of collusion and—well, let’s be frank here—organized conspiracy unthought of outside certain labs in South Korea.

In the meantime, as soon as the news from Alabama hit my screen, I pulled up the f1000 website and searched for the implicated articles. I’m pleased to say that we now reflect the current state of the scientific record (as you
may verify for yourself at this free link).

(Cross-posted)

Bit of history first. PDB – Program Debug Database is essential sometimes during debugging. By default, stack trace points to the function where problem lies and don’t include line numbers at which errors are thrown. Sometime this becomes quite critical for a serious production issue. Best practice seems to build PDBs during your build process (both Debug / Release), exclude them while creating your installers, and ship them to production when you need to diagnose your code. Another related thing you might want to keep in mind while debugging some critical issue – you can create a debug build by turning off code optimization (project properties -> Build Tab -> Optimize Code (uncheck)). This helps you to get an accurate stack trace devoid of any code optimizations like inline functions. Let’s get back to PDBs, the topic of this post. Enabling PDB effect normally is done by turning them on (Project Properties -> Build -> Advanced -> Debug Info = pdb-only) and copying generated PDBs to deployment directory. But when you are using ClickOnce things are different. In ClickOnce, the assemblies are downloaded the client’s local machine and then executed (deriving the benefit of auto update). So how do you ensure that the client download PDBs with assemblies? Fortunately VS.NET simplifies this for us. Steps are below:

1) Go the publish tab of your project file and click on “Application Files” button.

2) By default PDB files are not bundled for publish. You need to check “Show All Files” check box and then you would get to see PDB. PDB again is excluded by default, so include them. And you are all set to get line numbers and file names with your stack trace.

Hope this helps .

Kian terintegrasinya sistem keuangan memberikan dampak bukan saja kepada jumlah transaksinya, tetapi juga jenisnya. Apa pun jenis kegiatan keuangan pada akhirnya akan bermuara kepada suatu transaksi keuangan yang dieksekusi melalui perbankan. Oleh sebab itu, sektor perbankan apabila tidak dikelola dengan baik akan menghancurkan kredibilitasnya sebagai lembaga kepercayaan.

Keterkaitan sektor perbankan dengan stabilitas sistem kengan bukan hanya dalam hal fungsinya sebagai penyelenggara dan pengelola transaksi, tetapi juga karena fungsinya sebagai lembaga intermediasi dan transmisi moneter. Peran dan fungsi perbankan yang strategis itulah yang menyebabkan dalam setiap krisis selalu ada upaya bagaimana menjaga stabilitas perbankan.

Tata kelola bank di negara man pun selalu ketat dan cenderung sangat ketat (over regulated), dengan alasan utamanya adalah menjag kepercayaan masyarakat. Namun demikian, tetap berlaku juga norma umum bahwa di antara yang baik selalu saja ada yang tidak baik. Oleh sebab itu, sekalipun sangat ketat tata kelolanya selalu saja ada tindak kejahatan di perbankan.

Kejahatan perbankan yang pada umumnya terjadi disebabkan oleh apa yang disebut dengan error omission dan error commission. Apa yang dimaksud dengan error omission adalah kejahatan yang dilakukan dengan secara sengaja melanggar peraturan yang ada. Sedangkan error commission adalah kejahatan yang dilakukan karena tidak ada atau belum ada peraturannya. Tentunya banyak penyebab mengapa selalu terjadi error omission maupun error commission, akan tetapi hasilnya sama, yaitu terjadinya kegagalan bank.

Menyelamatkan bank pada ahirnya menjadi salah satu solusi baik dalam rangka menjaga kepercayaan maupun stabilitas sistem keuangan yang tentunya akan berujung pada terjaganya kesinambungan perekonomian. Mengapa Federal Deposit Insurance Corporation (FDIC), yaitu lembaga penjamin simpanan di Amerika Serikat, didirikan pada tahun 1936, tidak lain sebagai jawaban atas terjadinya krisis ekonomi yang luar biasa (great depression) pada tahun 1933.

Semenjak Amerika Serikat mempunyai FIDC, pada akhirnya semua negara menyadari diperlukannya lembaga serupa sehingga hampir di seluruh negara telah mempunyai lembaga penjaminan simpanan. Tujuannya pada umumnya sama, yaitu antara lain menjamin dana simpanan dan menyelamatkan atau tidak menyelamatkan bank.

Biaya mahal

Mengapa menyelamatkan bank sebagai pilihan (yang) pada hakikat(nya) krisis keuangan yang berdampak kepada krisis perbankan menimbulkan biaya yang menjadi beban fiskal, yang harus ditanggung pemerintah.

Honohan dan Klingebiel (2003) memperkirakan besarnya untuk mengatasi biaya krisis perbankan berkisar 13 persen dari GDP. Dengan mempertimbangkan besaran biaya tersebut, ada kecenderungan pemerintah dan lembaga pengawas perbankan menghindari untuk menutup bank gagal (Klingebiel dan Laeven, 2003).

Pascakrisris, baik yang terkadi tahun 1997 maupun tahun 2007, banyak negara yang mengalami kejadian yang sama, yaitu terjadinya kegagalan sebuah bank sebagai akibat dari krisis ekonomi. Tidak ketinggalan, di Indonesia mengalami hal yang sama, misalnya penutupan Bak IFI dan kemudian penyelamatan Bank Century.

Penyelamatan Bank Century pada akhirnya menimbulkan polemik. Penyebabnya bisa karena dalam rangka menggunakan hak berdemokrasi, merasa lebih paham, dan mungkin justru tidak paham tetapi harus berkomentar. Harus saya akui dengan jujur, saya tentunya termasuk kriteria tersebut di atas sekali pun tidak ada kesengajaan berniat seperti itu.

Sejatinya mengapa sebuah bank ada yang diselamatkan dan tidak, harus dilihat dari pemikiran secara holistik (menyeluruh dan terkait), yaitu dalam kaitannya menjaga stabilitas sistem perbankan di satu pihak dan menjaga kepercayaan masyarakat di lain pihak. Lebih penting dari itu tentunya adalah sebagai upaya menghilangkan efek domino, baik terhadap sistem perbankan maupun perekonomian dalam arti luas.

Polemik yang terjadi menurut hemat saya bisa terjadi karena ketiadaan kemauan menggunakan “bahasa” yang sama, baik dalam melihat persoalan maupun menyimpulkannya. Pengertian menggunakan “bahasa” yang sama bukan berarti harus disamakan pendapatny, akan tetapi lebih kepada imbauan kalau terjadi perbedaan pendapat itu harus rasional dan proporsional.

Dalam kasus penyelamatan Bank Century misalnya, ada ketidakseimbangan perlakuan dan perhatian. Upaya mengejar pertanggungjawaban pemilik Bank Century berjalan lebih lamban dibandingkan mempersoalkan apakah kegagalan Bank century itu sistemik atau tidak. Ironisnya, pemilik dan pengurusanya sebagian masih bebas berkeliaran di luar negeri. Celakanya, pendapat mereka dikutip seolah-olah pasti tak bersalah.

Seuogoamua semua pihak berpendapat bahwa kalau dapat dibuktikan adanya error omission dan atau error commission baik sebelum dan sesudah penyelamatan Bank Century harus dilakukan secara obyektif, jujur, dan tidak dipolitisasi. Sebab kalau tidak, maka sama artinya kita semua menciptakan ketidakstabilan yang baru, baik di sektor perbankan pada khususnya, dan perekonomian pada umumnya.

Sumber  :

Kasus Century : Menyelamatkan Bank, Krisna Wijaya | Praktisi dan Pengamat Perbankan
Kompas, 02.12.2009

Biology has become an increasingly data-rich subject. Many of the emerging fields of large-scale data-rich biology are designated by adding the suffix ‘-omics’ onto previously used terms. The importance to the life-science community as a whole of such large-scale approaches is reflected in the huge number of citations to many of the key papers in these fields; the human and mouse genome papers being the most obvious examples.

Well, in true sense, “Omics” is a general term for a broad discipline of science and engineering for analyzing the interactions of biological information objects in various ‘omes’. The main focus is on:
1) mapping information objects such as genes, proteins, and ligand.
2) finding interaction relationships among the objects
3) engineering the networks and objects to understand and manipulate the regulatory mechanisms
4) integrating various omes and omics subfields.

Structural Genomics is one such stream where a proper study of cellular and genetic components is performed. The RCSB Protein Data Bank (PDB) offers online tools, summary reports and target information related to the worldwide structural genomics initiatives from its portal at http://sg.pdb.org.

There are currently three components to this site:
1) Structural Genomics Initiatives contains information and links on each structural genomics site, including progress reports, target lists, target status, targets in the PDB and level of sequence redundancy.
2) Targets provides combined target information, protocols and other data associated with protein structure determination
3) Structures offers an assessment of the progress of structural genomics based on the functional coverage of the human genome by PDB structures, structural genomics targets and homology models.

This is a free, comprehensive resource produced in a collaboration between the Protein Structure Initiative (PSI) and Nature Publishing Group (NPG) and is of a great help to the scinetific research community.

More about this can be read at: http://nar.oxfordjournals.org/cgi/content/full/34/suppl_1/D302

KOMPAS.com — Kekayaan para miliarder yang masuk daftar orang terkaya di Amerika Serikat atau Forbes 400 menyusut sebesar 300 miliar dollar AS, atau sekitar Rp 3.000 triliun dengan kurs Rp 10.000 per dollar AS.

Uang senilai 300 miliar dollar AS tentu bukan hal yang main-main. Dengan dana sebesar itu banyak hal yang bisa dilakukan, bahkan untuk “membeli” sebuah negara. Sebagai contoh, kekayaan taipan kasino yang “tinggal” 9 miliar dollar AS masih mampu untuk “membeli” Barbados, yang mempunyai produk domestik bruto 9 miliar dollar AS.

Bayangkan apa saja yang bisa diperbuat dengan dana 300 miliar dollar AS. Berikut beberapa hal yang bisa dilakukan dengan dana 300 miliar dollar AS tersebut.

1. Anda bisa melakukan 8.571 perjalanan ke luar angkasa. Maret lalu, salah seorang petinggi Microsoft, Charles Simonyi, membayar 35 juta dollar AS untuk berjalan-jalan selama 10 hari di luar anglasa.
2. Kita pun bisa membeli 5.128 Gulfstream G650s. Pesawat jet tercepat yang bernilai 58,5 juta dollar AS.
3. Kita bisa membeli Google sebanyak dua kali. Nilai perusahaan raksasa internet tersebut mencapai 150 miliar dollar AS.
4. Bisa “membeli” Afrika Selatan yang mempunyai PDB 300 miliar dollar AS.
5. Setengahnya PDB Indonesia tahun 2009, yang mencapai Rp 5.309 triliun. Berarti kita masih harus nombok setengahnya lagi bila ingin “membeli” Indonesia.
6. Anda bisa melakukan 176.471 kali makan siang bareng taipan Warren Buffett. Pemenang lelang amal makan siang bersama Buffett harus membayar 1,7 juta dollar AS.
7. Kita bisa tinggal 32.877 tahun di presidential suite di Hotel Atlantis Bahama. Tarif termahal di hotel tersebut mencapai 25.000 dollar AS per malam.

Nah kalau Anda mempunyai duit 300 miliar dollar AS, apa yang akan Anda lakukan?

La moció, que va ser presentada per ERC, va contar amb el respatller de CIU i el Partit Democràtic de Blanes (PDB), mentre que el PP i el PSC van votar en contra. EUiA es va abstenir.

Saya sering bermimpi, andaikata pemerintah mampu melakukan efisiensi dan penegakan hukum di segala bidang, niscaya negara kita akan memiliki cukup anggaran. Dengan anggaran itu Indonesia bisa leluasa membeli berbagai peralatan militer atau yang disebut sebagai alat utama sistem persenjataan (alutsista). Maka, terwujudulah postur TNI yang kuat. Tentu saja mimpi itu terlalu menyederhanakan berbagai persoalan, akan tetapi seperti juga Wright bersaudara menyederhanakan keinginan manusia terbang hingga kemudian tercipta pesawat. Bukan tidak mungkin dari mimpi sederhana ini kemudian akan terwujud kan?

Saya bermimpi, Indonesia punya anggaran untuk membuat skuadron utuh pesawat tempur minimal sebanyak jumlah provinsi. Dengan demikian, saat ini diperlukan 33 skuadron utuh. Padahal, Indonesia saat ini hampir tak punya skuadron utuh yang berkekuatan 16 pesawat siap terbang. Yang ada hanya skuadron tak utuh. Dengan demikian maka kelak kita akan memiliki 528 pesawat berjenis tempur/serang (fighter/attack) untuk menjaga kedaulatan udara kita. Bandingkan dengan sekarang yang hanya punya 6 skuadron tempur, 5 skuadron angkut, 3 skuadron heli, dan sebuah skuadron intai. Kalau mau dimasukkan juga masih ada skuadron pendidikan dan Satudtani (Satuan Udara Pertanian). Itu pun campuran dan hampir semuanya bukan skuadron utuh. Total jumlah pesawat kita yang siap terbang dari berbagai jenis sekitar 100 unit. Tentu saja alutsista lain misalnya alat penginderaan seperti radar dan pesawat jenis lain seperti helikopter angkut juga mutlak ditambah.

Demikian pula bagi angkatan laut, tentu saja saya bermimpi kita memiliki kapal induk, bahkan minimal dua. Pembagian armada angkatan laut menjadi barat dan timur cukup memadai. Namun akan sangat memadai bila ditambah armada tengah. Jumlah kapal-kapal tempur lain pun harus diperbanyak. Tidak seperti sekarang dimana Indonesia hanya memiliki 2 kapal selam uzur, 6 fregate dan 23 corvettes. Selain itu cuma ada kapal militer berjenis pendukung seperti untuk logistik, patrol dan amfibi dengan total jumlah kapal sekitar 140 kapal berbagai jenis.

Bagi angkatan darat, tentu diperlukan unsur tempur yang lebih memadai. Meski memiliki jumlah anggota atau personel paling banyak, akan tetapi peralatan tempur yang dimiliki kebanyakan hanya bersifat angkut personel. Indonesia bahkan sama sekali tidak punya satu pun Main Battle Tank (MBT) sebagai kavaleri paling kuat bagi matra darat. Bahkan Kopassus sebagai pasukan paling elite dalam struktur TNI pun tidak punya helikopter tempur modern, hanya ada helikopter varian militer dari versi komersial seperti NBO-105. Padahal, sudah lazim sebuah pasukan khusus punya unit udara kuat misalnya dilengkapi helikopter AH-64 Apache. Kita juga tidak lagi punya rudal darat ke darat maupun darat ke udara yang memadai seperti di dekade 1960-an. Artileri pun mengalami nasib serupa.

Kendala utama dari pengadaan alutsista lagi-lagi persoalan anggaran. Dengan APBN (Anggaran Pendapatan dan Belanja Negara) yang hanya 20 persen dari PDB (Produk Domestik Bruto) dan anggaran pertahanan hanya 1 persen dari PDB, tentu dana sebesar itu justru habis untuk gaji personel yang berjumlah 432.129 orang dan pemeliharaan alutsista. Hampir mustahil untuk melakukan pembaharuan alutsista.

Sebenarnya, masalah pertahanan terkait erat dengan ekonomi. Daya tawar kita di dunia internasional akan makin kuat bila militer kita kuat. Lepasnya Timor-Timur dan Sipadan-Ligitan serta konflik di Ambalat, Aceh, Papua, Maluku dan berbagai insiden penerobosan alutsista asing seperti pesawat tempur F/A-18 milik AU-AS (USAF) pada 3 Juli 2003 menunjukkan betapa lemahnya militer kita.

Salah satu cara memperbesar kekuatan militer kita sebenarnya adalah dengan mengoptimalkan industri dalam negeri. Indonesia sudah punya hampir semuanya dalam industri militer, yaitu PT DI (pesawat), PT PAL (kapal laut), PT Pindad (alutsista darat), dan PT Dahana (bahan peledak). Kita bahkan juga punya industri hulunya seperti PT Krakatau Steel (besi dan baja). Ini bukan saja membanggakan, tapi sangat potensial untuk dikembangkan.

Tengoklah RRC yang kini punya setidaknya 11 BUMN di industri militer. Selain untuk memenuhi kebutuhan angkatan bersenjatanya yang memiliki jumlah personel terbesar di dunia (lebih dari 1 juta tentara aktif dengan sekitar 200 ribu cadangan dan rakyat terlatih), RRC juga sudah mampu mengekspor alutsista. Maka, alutsista bukan lagi pemborosan, malah memberikan devisa bagi negara.

Namun sebelum itu dimulai, dimana pastinya diperlukan modal awal dan alih-teknologi, kita perlu melakukan revolusi di bidang ekonomi. Berbagai pemborosan dan kebocoran anggaran harus ditekan. Fungsi pengawasan terutama untuk tindak pidana korupsi harus diperketat. Jangan seperti sekarang yang malah seperti ketakutan saat korupsi hendak diberantas, karena banyaknya yang merasa terlibat.

Jika negeri kita bebas korupsi dan berbagai bentuk penyelewengan anggaran, bukan saja akan berefek pada ekonomi, tapi juga pada pertahanan. Dengan pertahanan yang kuat, posisi Indonesia dalam perdagangan dan diplomasi internasional akan makin kuat. Akibatnya, pasar produk Indonesia akan makin terbuka di luar negeri. Itulah manfaat lain dari kekuatan militer yang kuat. Bukankah seperti kata Letjen Urip Sumohardjo, mustahil suatu negara zonder tentara? Akan tetapi, yang dibutuhkan oleh negara kita adalah tentara yang profesional, bukan yang menjadikan rakyat target latihannya. Artinya, TNI yang selalu siap menghadapi ancaman serangan dari luar maupun pemberontakan  dari dalam setiap saat, namun tetap dengan mengedepankan kepentingan rakyat.

Akhirul kalam, dirgahayu TNI! Semoga tetap tabah dan setia menjaga negara. Walau saat ini dengan anggaran seadanya…

Keterangan foto: Logo HUT ke-64 TNI, 2009.

Sumber foto: tni.mil.id

Tulisan ini juga diposting di Politikana

Pemerintah diharapkan lebih fokus dalam menetapkan kebijakan pembangunan industri. Industri berbasis pertanian dan energi seharusnya menjadi perhatian. Selain itu, empat dari 10 kluster industri unggulan harus dijadikan pendorong pertumbuhan ekonomi.

Demikian yang tercantum dalam Visi 2030 dan peta arah (roadmap) pembangunan industri 2010 – 2015 yang telah disusun Kamar Dagang dan Industri (Kadin) Indonesia. Rekomendasi itu disampaikan kepada para pemimpin media masa di Jakarta, Selasa (15/9), untuk mendapatkan masukan.

Empat kluster yang dijadikan pendorong pertumbuhan itu adalah industri makanan dan minuman, industri tekstil dan produk tekstil serta alas kaki, industri elektronik, serta industri alat angkut dan komponen otomotif.

Menurut pengamat ekonomi Faisal Basri, perekonomian Indonesia sudah berada pada fase deindustrialisasi. Peran industri manufaktur mencapainya pada 2001 dengan kontribusi 27,7 persen dari produk domestik bruto (PDB).

Namun, sejak saat itu peran industri manufaktur terus menurun, hingga pada 2007 hanya 27,1 persen dari PDB. Namun, pada 2008 kembali meningkat menjadi 27,9 persen.

Sektor industri manufaktur, kata Faisal, biasanya mengalami penurunan setelah mencapai 35 persen dari PDB. Penurunan prematur akan membawa implikasi pada penyerapan tenaga kerja.

“ Industri tidak berkembang karena tidak ada investasi dan tidak ada sokongan likuiditas, “ kata Faisal.

Menurut Wakil Ketua Umum Kadin Indonesia Bidang Perindustrian, Riset, dan Teknologi Rachmat Gobel, pertumbuhan ekonomi 4 – 5 persen dan stabilitas politik saat ini seharusnya bisa menjadi modal untuk mendorong pertumbuhan ekonomi.

Pasar potensial

Menanggapi industri alat angkut yang termasuk dalam empat kluster industri yang seharusnya menjadi pendorong perekonomian, Direktur Pemasaran PT Toyota Astra Motor Joko Trisanyoto menyatakan, industri alat angkut hanya dapat berkembang bila diperkuat industri komponen.

“ Saya melihat industri komponen dalam negeri masih semu karena bahan bakunya masih impor, “ ujar Joko.

Situasinya berbeda dengan industri makanan dan minuman yang setiap tahun selalu menunjukkan pertumbuhan. “ Industri makanan dan minuman selalu tumbuh karena ada penopangnya sekitar Rp 1.000 triliun. Ini karena diversifikasi pangan terus terjadi, begitu harga bahan pangan naik, “ kata Ketua Umum Gabungan Pengusaha Makanan dan Minuman Indonesia (Gapmmi) Thomas Darmawan.

Sementara industri tekstil, kata Sekretaris Jenderal Asosiasi Pertekstilan Indonesia (API) Ernovian G Ismi, menghadapi serangan barang selundupan. “ Belum tuntas, industri terancam lagi dengan rencana kenaikan tarif dasar listrik, “ ujarnya.

Menurut Redaktur Pelaksana Metro TV Suryopranoto, dibutuhkan pembenahan yang komprehensif di sektor industri.

Adapun Wakil Pemimpin Umum Bisnis Indonesia Ahmad Djauhar menilai, visi industri dari masa ke masa hanya mengikuti selera pejabatnya. Tidak pernah ada rancangan besarnya.

Menanggapi peta industri yang disusun Kadin, Wakil Redaktur Pelaksana Kompas Andi Suruji mengingatkan, semestinya roadmap yang disusun Kadin memiliki komparasi dengan industri di luar negeri agar bisa menjadi pijakan untuk menentukan posisi industri Indonesia di tengah percaturan dunia. “ Kadin juga perlu pnya tim komitmen untuk menggiring implementasi roadmap ini, “ ujarnya.

Pengamat ekonomi Indef Iman Sugema meminta Kadin jujur pada rencana aksi yang akan dilakukan oleh Kadin sendiri. “ Tidak bisa hanya meminta sejumlah keinginan pada pemerintah. Saya memahami, problem dalam menentukan kebijakan adalah sinkronisasi antara industrialis dan pandangan tentang pengembangan industri, “ ujar Iman.

Sumber  :

Pemerintah Harus Fokus – Kompas, 16.09.2009
Grafik : Bestari

Brookings just published an interesting report entitled, “The US Intelligence Community and Foreign Policy: Getting Analysis Right” — lots of interesting things here, and worth checking out.

The two top findings were:

Overemphasis on the President’s Daily Brief (PDB) – President George W. Bush elevated the PDB to an unprecedented level of importance, which had the unintended effect of skewing intelligence production away from deeper research and arms-length analysis to being driven by the latest, attention-grabbing clandestine reports from the field.

and…

Disappointing National Intelligence Estimates (NIEs) – NIEs are meant to be one of the major products of the IC, yet they are frequently too late, too long, and too detailed to serve high-level policymakers well. Moreover, NIE analytic quality is often compromised by the effort to present a unified analytic position, producing reports that can become the lowest common denominator statement that is able to achieve agreement across the IC silos.

Read the whole thing.

Developing in-house game tools presents a myriad of debugging issues. You can’t always nail down bugs to reproducible steps (if you even have QA resources to concentrate on that). Frequently content creators will complain about rare issues that force them to reboot the tools or use bizarre workarounds then things go wrong. Remote debugging works in some of these scenarios, but is mainly useful for debugging crash bugs. Errant “drag and drop” or “click and drag” problems require sitting at the machine to properly deal with.

In these cases its handy to be able to deploy a debugger onto the user’s machine so you can dive in and see where your code is going wrong. To be successful at this you need a couple of components: the debug symbols from the compile, the source code, and a debugger.

On Windows the debugging symbols are separate files from the executables. PDB files contains the information debuggers need to map addresses of code and data in a running tool to the source code counterparts. In Visual Studio, PDBs are only generated in the Debug configuration by default, so assuming you distribute something like a Release build to your users you will need to turn on PDB generation in that configuration. Its under Linker… Debugging… Generate Debugging Info. Set it to Yes (/DEBUG). When you prepare and publish your tool set, make sure to include these PDBs with the executables (EXE and DLL files).

PDBs can get quite large, so it may be a good idea to not always pull down PDB files when users get the latest tools. Insomniac’s tools retrieval script has some command line flags to pull down PDBs and code only when we know we want to debug something on a user’s machine. Using -pdb will get the executables and PDBs, and -code will get the executables, PDBs, and source (all from a label populated when the tools executables were checked in).

Once you have the PDB and code on the machine you just need a Debugger to dig in with. On Windows you have a choice: Visual C++ Express Editions or WinDBG (from Debugging Tools for Windows). Both are free to install so you aren’t bending any license agreements here. Visual C++ should work pretty much like you expect on your development box, but can take a while to install and patch to the latest service pack. WinDBG on the other hand is very quick to install, but takes a little getting used to. Typically you must show the UI you want to use (Callstack, Memory, etc…), as well as potentially manually setting the PDB search path (from File… Symbol File Path). It’s a very different experience but its so quick to deploy it may be worth checking out.

Dalam beberapa pekan mendatang, dunia usaha menyiapkan diri memasuki tahun 2010. Pertanyaannya adalah bagaimana warna perekonomian Indonesia 2010 ? Jawaban atas pertanyaan itu diterjemahkan oleh setiap perusahaan.

Mungkin kita sependapat, perekonomian 2010 diharapkan lebih baik dibandingkan saat kita menyiapkan perekonomian 2009. Saat itu, Agustus-Oktober 2008, perekonomian dunia sedang dalam puncak krisis dan berdampak pada perekonomian kita. Indeks harga saham berguguran, nilai uang rupiah jatuh terhadap dollar AS, dan krisis itu mencekam dunia perbankan. Karena itu, amat bisa dimaklumi, prospek perekonomian 2009 dalam kacamata waktu itu sungguh suram.

Pendapatan 2009

Meski demikian, pada pekan-pekan terakhir ini, warna perekonomian kita terasa mulai cerah sehingga cara pandang kita untuk 2010 menjadi berbeda.

Pada pekan-pekan ini banyak dunia usaha merasakan permintaan produk mereka meningkat kembali sehingga peningkatan kapasitas mulai terjadi di sana-sini dan investasi dirasakan bergerak naik. Industri properti juga merasakan tanda-tanda akan hadirnya kebangkitan kembali.

Sementara itu, penjualan mobil pada Juni dan Juli 2009 sudah menyamai rata-rata penjualan bulanan sepanjang 2008. Sedangkan produk utama ekspor kita – batu bara dan kelapa sawit – merasakan harga yang tidak terlalu buruk sehingga menghasilkan daya beli bagi daerah penghasil komoditas itu untuk produk-produk industri dari Jawa.

Pada tahun 2008 kita merasakan adanya peningkatan pendapatan penduduk Indonesia, dari sebesar 1.946 dollar AS (2007) menjadi 2.271 dollar AS per kapita (2008). Secara keseluruhan produk domestik bruton (PDB) 2008 adalah sebesar 514 miliar dollar AS sehingga Bank Dunia menempatkan Indonesia di urutan ke-19 dalam perekonomian dunia. Ini berarti sebuah peningkatan 325 dollar AS per kepala dalam hitungan satu tahun.

Atas perkembangan PDB kuartal pertama dan kedua serta pergerakan nilai tukar rupiah, pada tahun 2009, amat mungkin pendapatan per kepala adalah 2.500 dollar AS – 2.600 dollar AS, dengan PDB keseluruhan bergerak pada kisaran 570 miliardollar AS.

Pendapatan sebesar itu merupakan jumlah yang cukup besar bagi masyarakat Indonesia sehingga akhirnya menghasilkan daya beli yang kian meningkat. Inilah yang pada hakikatnya menjadi penopang besar bagi perekonomian Indonesia.

Prospek 2010

Bagaimana prospek tahun 2010 ?

Dalam penyampaian nota keuangan di depan DPR, Presiden Susilo Bambang Ydhoyono mengemukakan, ekonomi Indonesia 2010 diprediksi tumbuh sekitar 5,0 persen. Banyak pihak meyakini, pertumbuhan ekonomi kita bisa lebih tinggi dari itu. Itu sebabnya, dalam perdebatan di DPR, akhirnya disepakati perkiraan pertumbuhan ekonomi sebesar 5,5 persen.

Optimisme semacam ini sungguh penting untuk memberi dorongan lebih besar bagi pelaku ekonomi untuk mencapainya atau bahkan melampauinya. Inilah kekuatan self fulfilling prophecy.

Secara rutin, saya mengamati perkembangan PDB nominal, yaitu PDB yang menggunakan harga sebagaimana dirasakan hari-hari ini. PDB nominal ini lebih mirip berbagai laporan keuangan perusahaan, sementara PDB riil lebih mirip perkembangan tonase produksi perusahaan. Ternyata PDB nominal Indonesia tumbuh tinggi.

Pada tahun 2008, saat perekonomian (PDB) riil tumbuh 6,1 persen. PDB nominal justru tumbuh 25 persen. Kuartal pertama 2009, pertumbuhan PDB nominal sebesar 16,9 persen dan pada kuartal kedua menjadi 10,9 persen. Dengan prospek pertumbuhan lebih tinggi pada kuartal ketiga dan keempat, diyakini PDB nominal akan naik sehingga secara keseluruhan pertumbuhan tahun 2009 berada sekitar 15 persen. Jika ini terjadi, PDB nominal kita akan mencapai sekitar Rp 5.700 triliun. Angka ini kurang lebih sama dengan prediksi PDB nominal sekitar 570 miliar dollar AS, seperti disebutkan sebelumnya.

Dengan latar belakang itu, saat PDB riil diprediksi tumbuh 5,5 persen, PDB nominal 2010 akan tumbuh 15 – 18 persen. Jika ini terjadi, sepanjang 2010, PDB nominal kita akan mencapai Rp 6.500 triliun – Rp 6.600 triliun. Ini berarti PDB per kapita tahun 2010, dengan catatan nilai tukar rupiah bergerak menguat sebagaimana terjadi akhir-akhir ini, akan berada pada 2.800 dollar AS – 3.000 dollar AS.

Indonesia-Malaysia

Saya suka membandingkan pendapatan Indonesia dengan malaysia karena berbagai sentimen yang berkembang. PDB Malaysia per kapita tahun 2008 sekitar 7.000 dollar AS. Jika pada tahun ini PDB mereka tidak banyak berkembang (semester pertama 2009 perekonomian Malaysia kontrajsi sebesar 5,0 persen), pada tahun 2010 PDB per kapita mereka mungkin akan berada di sekitar 7.500 dollar AS. Sementara itu, PDB per kapita 10 persen penduduk Indonesia, 23 juta orang, sebesar 8.400 dollar AS – 9.000 dollar AS. Jika jumlah penduduk Indonesia disamakan dengan Malaysia, sekitar 27 juta orang, pendapatan per kapita rata-rata dari 27 juta orang pendapatan tertinggi Indonesia akan mencapai 7.800 dollar AS (dengan catatan empat juta penduduk Indonesia masuk bracket 10 persen berikutnya yang berpendapatan rata-rata 4.300 dollar AS – 4.500 dollar AS). Sementara 90 persen penduduk berikutnya menghasilkan daya beli yang sangat besar.

Inilah sebabnya penjualan mobil bulanan Indonesia mampu menyamai Malaysia. Ini pula yang menyebabkan jumlah mal di Jakarta lebih banyak dan lebih besar dibandingkan dengan Malaysia. Hal inilah yang seharusnya mengarahkan pandangan dunia usaha, ke mana dan industri apa yang harus dijalankan, serta pusat investasi apa yang harus dilakukan.

Sumber  :

Perekonomian Indonesia 2010, Cyrillus Harinowo Hadiwerdoyo | Pengamat Ekonomi
Kompas, 08.09.2009

Ada kejadian kontras di sektor keuangan di Amerika Serikat dan Indonesia dalam dua minggu terakhir. Di AS, sebagai pusat penyebab krisis keuangan global, Presiden Barack Obama yang berasal dari Partai Demokrat pada 25 Agustus 2009 telah menominasikan lagi Ben Bernanke yang berasal dari Partai Republik sebagai Gubernur Bank Sentral untuk periode jabatan kedua.

Presiden Obama mengatakan, Bernanke telah menunjukkan sikap tenang, tetapi tegas sehingga berhasil menghentikan kejatuhan drastis ekonomi AS. Ini adalah sikap positif masyarakat negara maju, yaitu dengan kepala dingin bisa memberikan apresiasi kepada orang-orang yang telah bahu-membahu bersama presiden mengatasi krisis walaupun orang itu berbeda partai politiknya.

Situasi pasar keuangan dunia, termasuk di Indonesia, sejak kuartal II-2009 terus menunjukkan pemulihan dan kembali berjalan normal. Namun, di Indonesia, setelah sektor keuangan berhasil keluar dari situasi gawat darurat, pemberitaan malahan berfokus kepada biaya penyelamatan Bank Century Rp 6,7 triliun, di mana jumlah tersebut jauh melebihi perkiraan awal (Rp 683 miliar).

Mari kita lihat situasi krisis sektor keuangan pada kuartal IV-2008 sampai dengan kuartal I-2009. Situasi pasar keuangan dunia masuk kondisi gawat darurat sejak dibangkrutkannya perusahaan keuangan Lehman Brothers pada 15 September 2008.

Pemerintah AS membiarkan Lehman Brothers bangkrut dengan maksud untuk memberikan pelajaran kepada para bankir dan para spekulan yang tamak. Namun, keputusan menutup Lehman Brothers pada saat kondisi pasar keuangan “sedang rapuh” ternyata malah membuat kepanikan besar di seluruh dunia.

Tentu saja kesalahan keputusan hanya bisa diketahui setelah terjadi. Suku bunga dollar di pasar uang internasional naik hampir empat kali lipat dari 1,5 persen menjadi 5 persen berhubung semua bank kemudian menghentikan transaksi pinjam-meminjam karena ketakutan akan adanya kebangkrutan susulan di berbagai institusi keuangan yang lain.

Kurs valuta asing, saham, dan obligasi di sejumlah negara jatuh drastis. Kepanikan di pasar uang internasional telah menyebabkan otoritas AS harus menyelamatkan perusahaan asuransi global AIG pada 16 September 2008 dengan menyuntikkan injeksi modal dan likuiditas 182 miliar dollar AS. Kemudian, 15 September, Bank of America diminta menyelamatkan perusahaan sekuritas Merril Lynch.

Kondisi darurat

Sampai dengan kuartal I-2009, situasi pasar keuangan dunia masih dalam kondisi darurat. Jika sektor keuangan rapuh, jangan harap sektor riil bisa jalan. Karena itu, upaya menstabilkan sistem keuangan adalah hal prioritas.

Pada 24 Nopember 2008, Pemerintah AS terpaksa harus menyetor modal kedua kalinya menjadi total 45 miliar dollar AS dan memberikan penjaminan 306 miliar dollar AS kepada Citigroup.

Bahkan, Januari 2009, Pemerintah AS harus menyetor tambahan modal kedua kalinya menjadi total 45 miliar dollar AS dan memberikan penjaminan 118 miliar dollar AS buat Bank of America, juga salah satu bank terbesar di sana.

Pada 16 Desember 2008, Bank Sentral AS bahkan menurunkan bunga ke 0,25 persen, yang bertahan sampai saat ini. Bayangkan, betapa besar biaya stabiliasi sektor keuangan oleh Bank Sentral AS, yang dalam waktu lima bulan (September 2008 – Februari 2009) mencapai 1,4 triliun dollar AS, setara dengan 10 persen produk domestik bruto (PDB) AS.

Di Indonesia, penanganan menghadapi krisis keuangan global dipuji banyak pihak. Presiden Susilo Bambang Yudhoyono telah menunjukkan sikap kepemimpinannya ketika memimpin sidang kabinet paripurna 6 Oktober 2008, mengajak semua pihak bahu-membahu mengatasi krisis keuangan global. Setelah sidang kabinet 6 Oktober 2008, presiden proaktif mencari input dari para ekonom, asosiasi pengusaha, dan akademisi bagaimana menangani krisis ekonomi global.

Walaupun upaya penanganan krisis ekonomi di Indonesia telah dilakukan otoritas keuangan sejak bulan September 2008, tetapi dengan adanya perhatian presiden, keputusan menjadi jauh lebih cepat. Pada 13 Oktober 2008, keresahan masyarakat penabung akan dana mereka di perbankan dapat diatasi dengan dinaikkannya penjaminan pemerintah atas tabungan masyarakat di perbankan dari Rp 100 juta – Rp 2 miliar.

Pada 14 Oktober 2008, untuk membantu likuiditas sektor keuangan, Bank Indonesia menurunkan giro wajib minimum dari 9 persen ke 7,5 persen. BI juga akhirnya mulai menurunkan BI Rate tanggal 4 Desember 2008, dari 9,5 persen ke 9,25 persen, dan saat ini 6,5 persen.

Di bidang fiskal, pemerintah menaikkan defisit anggaran dari 1 persen PDB ke 2,6 persen PDB demi stimulus ekonomi. Upaya penyelamatan Bank Century pada 21 Nopember 2008 adalah juga dalam rangka menjaga stabilitas sistem perbankan berhubung situasi keuangan pada saat itu masih dalam kondisi siaga satu.

Yang perlu dipertanyakan sebenarnya adalah mengapa pihak otoritas perbankan pada tahun 2004-2006 tidak bertindak tegas mengganti pemilik dan manajemen atau menutup Bank Century.

Secara umum kualitas pengawasan BI telah cukup baik sehingga apakah ada intervensi terhadap pengawasan Bank Century pada periode itu ? Ke depan, yang harus dijalankan pemerintah adalah bagaimana melanjutkan reformasi sektor keuangan sesuai ajakan presiden untuk melaksanakan reformasi tahap kedua di negara ini.

Di bidang keuangan, reformasi tentunya menyangkut reformasi governance, baik regulator maupun sektor keuangan. Jangan sampai reformasi yang sudah berjalan di beberapa BUMN, di kantor pajak dan bea cukai, berhenti sampai di sini atau bahkan menjadi mundur.

Sumber  :

Ketegasan Menjaga Stabilitas Sistem Keuangan – Mirza Adityaswara | Ekonom, Analis Perbankan dan Pasar Modal
Kompas, 07.09.2009

Python has a simple yet powerful builtin module for debugging called pdb. Using this module you can debug your python code easily even without any IDE.

1. First step is to import the pdb module

2. Next step is to mark the entry point where the debugger would be called in. We use the set_trace() method for that.
pdb.set_trace()

3. When the program is run the execution would stop at the set_trace() method and would wait for debugging commands.

4. To run the next statment enter ‘n’ or ‘next’

5. To print a variable enter ‘pp variable_name’

6. To run until exit enter ‘c’ or ‘continue’

7. To display the current location enter ‘l’ or ‘list’
This would display an appropiate part of the source code with a pointer to the current statement.

8. To step into a method enter ’s’ or ’step’ when debugger is met with a method

9. To insert a break point enter ‘b filename:linenumber’

10. You can also dynamically assign values into variables.
Let’s assume there is a variable called num initialized to 10. You want to see what would happen when that variable is initialized to 20. You just do this. (pdb) num = 20 and then enter ‘n’ to execute next statement or enter ‘c’ to execute program until the end.

An example would look like this

import pdb

def method():
i = 10
name = ‘kasun’
last_letter = name[-1]

last_num = ord(last_letter)

print ‘last_num is’, last_num
if __name__ == ‘__main__’:
pdb.set_trace()
method()

iphone app
iSilo係專看pdb文件工具~

((iSilo V.5.08 巳新增wifi傳輸))

pdb文件用WinSCP或ifunBox上傳上iphone.
路徑：private/var/mobile/Applications/
xxxxxxxxxxx數字英文字文件夾/
Documents/Downloads/
每部iphone裝iSilo既數字文件夾都唔一樣你要自己搵搵!你可以係上傳曰期同時間會比較快找到！

You know, I’m really getting to like Smashwords. Not only was it easy and straightforward to put my two crime novellas up on the site as e-books (“The Thirteenth Egg” and “Manhunt“) but the companyhas been very proactive in marketing itself (e.g. the joint competition with Editor Unleashed that really raised their profile among writers – and resulted in a great micro-fiction collection) and creating bigger audiences for their writers.

The latest move by Smashwords is to negotiate an agreement with Barnes & Noble to sell Smashwords e-books. As of today, over 800 Smashwords titles (including both of my own) have been added to the B&N catalogue. Many more are on their way. They won’t be available at B&N for a few days yet but soon they will be.

So, give it a week or so, and then start trying this search query at B&N.  The first person to buy a copy of “The Thirteenth Egg” – my latest Alexandra Bertolissio detective story – from B&N (you’ll need to send me the B&N receipt as proof of purchase) gets a free copy of ‘Manhunt’.

วันจันทร์ที่ 17 ส.ค. 52

ได้มีโอกาสไปนั่งฟังการบรรยายและสาธิตการใช้ โปรแกรม PyMOL … เนื่องจากบังเอิญภาควิชาชีวเคมีขอใช้ห้องคอมพิวเตอร์ของห้องสมุดสตางค์เป็นสถานที่เรียน เพื่อประกอบรายวิชาใหม่เอี่ยม “Structure and Mechanism of Enzymes” … และได้เชิญผู้เชี่ยวชาญจากศูนย์ BIOTEC สวทช มาสอนโปรแกรม PyMOL ให้แก่นักศึกษาด้วย

แม้จะเรียนไม่ค่อยรู้เรื่อง แต่ก็พอจับใจความได้บ้าง สรุปความรู้ใหม่ได้ดังนี้ค่ะ

• PyMOL เป็นอีกตัวอย่างหนึ่งของ การใช้เทคนิค Visualization กับงานทางวิทยาศาสตร์ และนี่เป็นการนำเสนอข้อมูลของโมเลกุล เป็นภาพ 3 มิติ
• PyMOL เป็นอีกตัวอย่างหนึ่งของ Opensource Software ซึ่งไม่ต้องเสียตังค์ซื้อ Download ได้ที่ http://pymol.org พัฒนาโดย Warren DeLano จาก DeLano Scientific LLC. ตอนนี้พัฒนามาจนถึง version 1.2 แล้ว
• นัยว่า นักศึกษาสาขาวิชาที่ควรรู้โปรแกรมนี้ ควรเป็นนักศึกษาสาขาเคมี ชีววิทยา ชีวเคมี เทคโนโลยีชีวภาพ ชีวสารสนเทศ และเภสัชกรรม (หรือพวกที่ทำยา นั่นแหละ)
• ตอนเรียน อาจารย์ให้ไป download ไฟล์ structure ตัวอย่างมา 2-3 ตัวจากฐานข้อมูล Protein Data Bank (PDB) โดยสามารถสืบค้นได้จากชื่อผู้แต่งบทความ หรือใช้รหัสของ Structures เลยก็ได้ เช่น 2IGK, 2IGM, 2IGN ฯลฯ … จากนั้นเก็บ file เอามาลองศึกษาโครงสร้างอย่างละเอียด โดยการหมุนไปรอบๆ แบบ 3 มิติด้วยโปรแกรม PyMOL
• ก็เลยได้รับความรู้ใหม่ เหมาะสำหรับชาวห้องสมุด (อย่างเราๆ) ว่า หากจะตีพิมพ์ผลงานวิจัยที่มี structures เหล่านี้อยู่ในบทความ เป็นกฎเหล็กของวารสารว่า ผู้เขียนบทความจะต้องช่วยกัน upload structures ไปส่งให้คลังข้อมูล (data bank) ซึ่งถือว่าเป็น public repositories หรือสมบัติสาธารณะของชาวโลก เพื่อให้คนอื่นได้ download structures ของเรา ไปทำการศึกษาต่อ … ในขณะที่บทคัดย่อจะไปปรากฏที่ฐานข้อมูล PubMed เพื่อให้เราสืบค้นบทความมาอ่านได้ อย่างที่เราทราบๆ กันดี

ไม่แน่นะ … ในอนาคต ชมรมผู้ใช้ไอทีมหิดล-พญาไท ของห้องสมุดสตางค์ มงคลสุข อาจเพิ่มหลักสูตรการอบรมโปรแกรม PyMOL ให้เป็นส่วนหนึ่งของกิจกรรมก็ได้ … ใครจะรู้

Indonesia akan mempertahankan pertumbuhan ekonomi pada tingkat 5% pada tahun 2010 dengan belanja lebih dari Rp1.009 triiyun. Pemerintahan Susilo Bambang Yudhoyono pada lima tahun kedua juga masih akan mempertahankan defisit anggaran pada tahun 2010.

Pertumbuhan Ekonomi Diharapkan tetap dikisaran 5 Persen

Direncanakan defisit akan mencapai Rp98 trilyun atau 1,6 persen dari product domestic bruto (PDB). Meskipun demikian angka defisit ini mengalami penurunan Rp 35 triliun kalau dibandingkan dengan target yang direncanakan dalam perubahan RAPBN 2009 sebesar Rp133 triliun atau 2,5 persen dari PDB.

“Belanja negara direncanakan mencapai Rp1.009,5 triliun atau yang berarti lebih tinggi sebesar Rp3,8 triliun dari yang dianggarkan dalam RAPBN-P 2009,” kata Yudhoyono. Yudhoyono merumuskan tiga kebijakan utama pemerintahnya yakni pro pertumbuhan (pro growth), pro mengentaskan kemiskinan (pro poor) dan pro penciptaan lapangan kerja (pro job).

Asumsi ekonomi

Sementara itu asumsi ekonomi makro untuk pertumbuhan ekonomi sekitar 5 % dengan tingkat inflasi 5%. Sedangkan nilai tukar rupiah rata-rata Rp10.000/dollar AS. Suku bunga sertifikat bank indonesia (SBI) tiga bulan rata-rata 6,5 persen.  Harga minyak mentah ditetapkan 60 dollar AS per barrel serta lifting minyak mentah mencapai 965.000 barrel per hari.

Pemerintah SBY juga menargetkan penerimaan pajak sebesar Rp729,2 triliun, Pendapatan Negara Bukan Pajak (PNBP) Rp180,9 triliun, alokasi belanja pemerintah pusat sebesar Rp699,7 triliun. Sedangkan alokasi anggaran kementerian/lembaga sebesar Rp327,6 triliun, alokasi anggaran Departemen Pendidikan sebesar Rp51,8 triliun dan alokasi anggaran Departemen Pertahanan sebesar Rp40,7 triliun.

Pemerintah juga mengalokasikan anggaran Departemen Pekerjaan Umum Rp34,3 triliun. Sementara itu, alokasi anggaran Departemen Agama Rp26 triliun dan alokasi anggaran Departemen Kesehatan Rp20,8 triliun. Sedangakan alokasi anggaran Departemen Perhubungan Rp16 triliun, dan alokasi anggaran Kepolisian Negara Rp25,8 triliun.

Gaji naik

Mengenai anggaran belanja pegawai akan mencapai Rp161,7 triliun dalam RAPBN 2010 mendatang. Angka ini naik Rp28 triliun atau 21 persen dari perkiraan realisasinya dalam tahun 2009.  Menurut Yudhoyono, kenaikan anggaran ini ditujukan untuk memperbaiki kinerja birokrasi dan peningkatan kualitas pelayanan publik.

Selain itu, anggaran juga dialokasikan untuk kenaikan gaji PNS, prajurit TNI/Polri, dan pensiunan sebesar rata-rata 5 persen. “Alokasi anggaran antara lain untuk memperbaiki penghasilan aparatur negara dan pensiunan melalui kenaikan gaji pokok dan pensiunan pokok rata-rata 5 persen, pemberian gaji dan pensiun bulan ke-13,” kata Yudhoyono.

Uang makan/lauk pauk bagi TNI/Polri juga mengalami kenaikan, dari Rp35.000 per hari menjadi Rp 40.000 per hari. Demikian pula uang makan PNS yang naik dari Rp15.000 per hari kerja menjadi Rp20.000 per hari kerja.

Dengan demikian, papar Presiden, pendapatan PNS golongan terendah mengalami kenaikan 2,5 kali lipat selama periode 2004-2009 . “Dari Rp674.000 per bulan pada tahun 2004 menjadi Rp1.721.000 pada tahun 2009 ,” ujarnya.

Sementara, untuk mewujudkan tata kelola pemerintahan dan pelayanan publik yang baik, pada tahun 2010 pemerintajan akan memberikan remunerasi kepada beberapa kementerian/lembaga yang telah dan sedang melakukan reformasi birokrasi.

Subsidi

Pemerintah Indonesia masih mempertahankan subsidi dalam anggaran tahun depan dengan besaran mencapai Rp144,4 triliun. Angka ini berarti 14,3 persen dari total APBN yang mencapai Rp1.009,5 triliun. Menurut Yudhoyono, di masa datang pemerintah perlu melakukan langkah-langkah penataaan kebijakan pokok subsidi agar alokasinya dapat lebih terarah dan tepat sasaran, sesuai dengan situasi yang dihadapi bangsa Indonesia.

Selain menata kebijakan subsidi secara umum, pemerintah juga akan membuat desain awal bagi kebijakan jangka menengah, meliputi berbagai sektor, antara lain pengalihan secara bertahap subsidi harga untuk BBM, listrik dan pangan, kepada subsidi yang tepat sasaran.  “Pemerintah juga akan membatasi pengguna subsidi, hanya kepada rumah tangga sasaran, sektor prioritas, dan pelayanan umum melalui sistem distribusi tertutup,” katanya.

Pemerintah tetap merencanakan alokasi anggaran untuk subsidi pupuk benih dan pangan. Di samping itu pemerintah menyediakan beras dengan harga murah, dan peningkatan alokasi anggaran subsidi bunga kredit program baik untuk kredit usaha rakyat

(KUR) maupun subsidi bunga untuk kredit perumahan sederhana dan sehat.

Masih ekspansif

Anggaran defisit 1,6% menunjukkan anggaran tahun depan masih tetap bersifat ekspansif, kata ekonom Danareksa Research Institute, Purbaya Yudhi Sadewa seperti dikutip Reuters. Sedangkan ekonom Bank Danamon Helmi Arman mengatakan kepada Reuters, pemerintah harus mendiversifikasikan sumber keuangan kedalam surat berharga mata uang Yen dan Sukuk.

Hal in harus diteruskan karena mengurangi persepsi risiko terhadap surat berharga yang didominasi rupiah.H elmi juga menjelaskan, pemerintah Indonesia harus mempertimbangkan kemampuan pasar domestik untuk menyerap utang baru karena tingkat pemilikan asing di pasar surat berharga sudah cukup besar dan hal ini akan membuat sumber kerawanan. Kahlil Rowter, Presiden Direktur Badan Pemeringkat Lokal Pefindo menjelaskan kepada Reuters bahwa karena defisit tinggi maka sulit sekali tingkat bunga pinjaman bank akan turun seperti yang diperkirakan. (BBC)

Perekonomian dunia mulai sedikit berseri. Pada triwulan kedua 2009, perekonomian Amerika Serikat hanya mengalami kontraksi sebesar 1 persen, jauh lebih baik daripada triwulan sebelumnya yang menyusut 6,4 persen.

Angka pengangguran pada bulan Juli turun untuk pertama kali sejak krisis keuangan meledak pada Desember 2007 menjadi 9,4 persen dari 9,5 persen pada bulan Juni.

Ekspor Jerman mulai tumbuh positif 7 persen pada bulan Juli lalu. Perekonomian Cina pada triwulan kedua tumbuh 7,9 persen, lebih tinggi dari perkiraan.

Koreksi ke atas sejumlah indikator ekonomi di sejumlah negara menumbuhkan keyakinan baru bahwa perekonomian dunia akan tumbuh lebih tinggi tahun depan.

Versi terakhir Dana Moneter Internasional (IMF) yang dikeluarkan bulan lalu menunjukkan bahwa pertumbuhan ekonomi dunia tahun depan sebesar 2,5 persen, naik 0,6 persen dibandingkan dengan perkiraan yang dikeluarkan bulan April.

Serangkaian indikator ekonomi Indonesia pun menunjukan kecenderungan yang sama. Ekspor bulan Juni naik, walau hanya 1,32 persen, dibandingkan dengan ekspor bulan Mei. Indeks produksi industri manufaktur besar dan sedang sudah kembali tumbuh positif pada triwulan kedua 2009, setelah dua triwulan berturut-turut sebelumnya berada pada zona negatif.
Konsumsi semen dalam empat bulan terakhir juga terus menunjukan akselerasi. Penjualan otomotif dan sepeda motor pun merangkak naik.

Arus masuk wisatawan mancanegara juga tetap mencatatkan pertumbuhan positif. Demikian pula dengan wisatawan domestik. Perkembangan positif ini mendongkrak tingkat hunian hotel hampir 5 persen, dari 47,8 persen pada bulan Mei menjadi 52,6 persen pada bulan Juni.

Memang, masih ada beberapa indikator yang terus melemah. Volume angkutan barang dalam negeri lewat laut, misalnya, pada bulan Juni turun dibandingkan Mei 2009.

Perbaikan indikator-indikator sektor riil beriringan dengan penguatan indikator makroekonomi jangka pendek. Laju inflasi (year-on year) selama 10 bulan turun tanpa jeda hingga mencapai tingkat terendah 2,7 persen pada bulan Juli – suatu pencapaian yang cukup menakjubkan selama sejarah perjalanan kita pascakemerdekaan.

Dengan tingkat inflasi yang rendah, Bank Indonesia secara konsisten melanjutkan penurunan suku bunga acuan (BI Rate) yang sudah berlangsung selama 11 bulan berturut-turut menuju 6,5 persen pada bulan Agustus ini.

Koordinasi yang lebih baik antara Bank Indonesia dan departemen Keuangan diharapkan bisa lebih cepat menurunkan suku bunga pinjaman.

Penanaman modal asing

Nilai tukar rupiah cenderung mengalami penguatan hingga di bawah Rp 10.000 per dollar AS. Penguatan rupiah diharapkan bisa berkelanjutan seandainya kita bisa memanfaatkan peluang dari kecenderungan penanaman modal asing langsung yang akan lebih banyak mengalir ke negara-negara yang skala pasar domestiknya relatif besar seperti Indonesia.

Bertolak dari kecenderungan itu, agaknya cukup beralasan untuk menyambut tahun 2010 dengan lebih optimistis. Apalagi mengingat pemenang pemilihan umum presiden adalah calon yang masih menjabat, dan satu putaran pula, sehingga memiliki keleluasaan untuk mempersiapkan segala sesuatunya dengan lebih baik menyongsing era baru.

Pemerintah baru secara de facto sudah terbentuk sehingga tidak membutuhkan masa transisi. Rencana Pembangunan Jangka Menengah (RPJM) bisa segera dirampungkan, tidak seperti pengalaman periode sebelumnya, yakni RPJM baru disahkan setahun setelah pelantikan kabinet.

Target pertumbuhan ekonomi sebesar 5 persen untuk tahun depan sebagaimana tercantum di dalam RAPBN 2010 tampaknya kurang sejalan dengan geliat optimisme yang sedang merekah.

Selain itu, pertumbuhan 5 persen adalah awal yang kurang meyakinkan untuk mewujudkan janji kampanye Susilo Bambang Yudhoyono – Boediono yang mematok target pertumbuhan rata-rata 7 persen selama periode 2010-2014.

Nisbah pajak (tax ratio) yang hanya naik tipis dari 12 persen tahun 2009 menjadi 12,1 persen pada tahun 2010 kurang mencerminkan klaim pemerintah atas keberhasilan reformasi pajak dan tekad untuk bekerja lebih keras.

Selain itu, asumsi nilai tukar rupiah yang dipatok Rp 10.000 per dollar AS tak sejalan dengan optimisme yang belakangan ini didengungkan oleh Menteri Keuangan dan petinggi Bank Indonesia.

Jika pemerintah memandang bahwa tahun 2010 masih merupakan masa transisi dan konsolidasi mengingat imbas krisis global masih belum akan sirna, mengapa defisit APBN justru diturunkan dengan cukup drastis, dari 2,5 persen produk domestik bruto (PDB) pada tahun anggaran berjalan menjadi hanya 1,6 persen PDB untuk tahun anggaran mendatang ?

Bukankah masih diperlukan ekspansi anggaran untuk mengimbangi penurunan laju konsumsi masyarakat yang sudah hampir pasti terjadi mengingat tak ada lagi stimulus dan subsidi seperti bantuan langsung tunai (BLT) maupun doping yang mengalir dari padatnya agenda politik ?

Sebaliknya, masyarakat harus bersiap-siap menghadapi tekanan daya beli akibat kenaikan harga-harga barang dan jasa karena selama dua tahun terakhir terkesan  kuat sangat dikendalikan untuk menjaga popularitas pemerintah menghadapi pemilu lalu.

Sangat boleh jadi asumsi-asumsi RAPBN 2010 yang terkesan konservatif disebabkan oleh bayang-bayang pertumbuhan ekonomi pada triwulan kedua yang melemah.

Menurut prognosis pemerintah, pertumbuhan ekonomi triwulan kedua akan merosot di bawah 4 persen, lebih rendah dibandingkan dengan trowulan sebelumnya sebesar 4,4 persen.

Namun, masih cukup waktu untuk membalikkan kecenderungan pada semester kedua. Jika tidak banyak gangguan baru dan perbaikan ekonomi global terus berlanjut, tak tertutup kemungkinan pertumbuhan ekonomi tahun ini justru mendekati 5 persen sehingga optimisme kita semakin besar untuk memasuki tahun 2010.

Ada baiknya anggota DPR menorehkan tinta emas pada akhir masa jabatannya untuk menghasilkan APBN 2010 yang lebih optimistis ketimbang rancangan pemerintah. Sepantasnya pemerintah baru nandi diberikan pekerjaan rumah yang lebih banyak dan terukur.

Sumber  :

Antiklimaks RAPBN 2010 – Faisal Basri
Kompas, 10.08.2009

Dunia sedang mengantisipasi dampak global defisit anggaran Pemerintah AS 1,09 triliun dollar AS (12,7 persen) dari produk domestik bruto .

Bahkan, defisit anggaran AS itu berpotensi menjadi 1,84 triliun dollar AS bila program-program populis dan sosial kelas menengah bawah harus dilanjutkan karena resesi. Kondisi ini diperberat utang sebesar 11,5 triliun dollar AS.

Untuk menutup defisit yang kian besar, Pemerintah AS menerbitkan obligasi bersuku bunga lebih tinggi. Hal ini mengundang kekhawatiran tentang jaminan pembayaran utang AS di kemudian hari, merosotnya nilai dollar AS, dan penurunan aset dalam dollar AS.

Dampak bagi Indonesia
Hal ini menjadi kabar buruk bagi Indonesia yang sekitar 16 persen APBN-nya ditutup dengan pinjaman luar negeri, termasuk penjualan obligasi. Mengingat faktor country risk, naiknya bunga obligasi Pemerintah AS membuat Pemerintah Indonesia harus menjual obligasi/SUN (surat utang negara) dalam dollar AS di pasar modal dengan bunga lebih tinggi agar tetap laku.

Obligasi Indo Bond 10 jatuh tempo 2014 bunga 10,735 persen. Indo Bond 11 jatuh tempo 2019 bunga 11,625 persen. Keduanya dalam denominasi mata uang asing, bunganya amat tinggi, karena itu oversubscribe dan kini harganya lebih tinggi dari penawaran awal. Mengapa obligasi Pemerintah Indonesia berbunga lebih tinggi dari obligasi Pemerintah Filipina ?

Tersedianya SUN mengurangi gairah bank menyalurkan kredit ke sektor riil. Deposito rupiah yang dihimpun bankm berbunga 6,1 persen, lebih untung dan aman jika dibelikan SUN dalam dollar AS daripada disalurkan untuk kredit.

Tahun ini adalah awal pemerintahan baru dan puncak jatuh tempo utangm suatu momentum untuk merenungkan kembali ketergantungan pada utang luar negeri.

Sebagai pengusaha, saya tahu betul arti tingginya bunga pinjaman, dan 10 tahun sebagai anggota kabinet, saya tahu persis beban utang bagi negara. Utang pemerintah Rp 112,19 triliun akan jatuh tempo dan 47 persen diantaranya dalam denominasi valas. Jumlah itu dua kali alokasi APBN 2009 Departemen Perhubungan dan Departemen Pekerjaan Umum. Sementara 22,6 miliar dollar AS utang luar negeri swasta jatuh tempao pada saat bersamaan.

Menteri Keuangan Sri Mulyani menjelaskan, rasio utang atas PDB menurun. Artinya kemampuan ekonomi negara untuk membayar kewajiban utang meningkat, cadangan devisa terhadap kewajiban jangka pendek (jatuh tempo kurang dari satu tahun) di kisaran 178 persen.

Pemerintah tampak percaya diri. Beban utang belum dianggap ancaman. Masalahnya, perhitungan PDB Indonesia merujuk output/produksi ekonomi nasional, termasuk yang dihasilkan perusahaan maupun tenaga kerja asing. Meningkatnya PDB Indonesia tak hanya dibentuk oleh kinerja orang Indonesia, tetapi juga peran asing sehingga balas jasa faktor produksi pada pihak asing akan menyita PDB Indonesia. Gambaran kemajuan ekonomi Indonesia menjadi bias. Pertumbuhan ekonomi relatif tinggi, tetapi jumlah pengangguran dan kemiskinan cenderung statis.

Menurunnyra rasio utang terhadap PDB diikuti meningkatnya stok utang. Tahun 2004, total utang pemerintah jika dirupiahkan Rp. 1.295 triliun. Tahun 2008 menjadi Rp 1.486 triliun, naik 15 persen dalam waktu empat tahun.

Utang baru

Anatomi APBN terdiri dari penerimaan pajak, bea cukai, dan PNBP. Utang dan pengeluaran berunsur biaya rutin (pembayaran gaji PNS), biaya pembangunan, bagian daerah (dana alokasi khusus dan dana alokasi umum), pembayaran bunga utang, dan pengembalian utang.

Dari segi APBN, beberapa tahun akhir ini, penerimaan negara di luar utang sudah lebih kecil dari biaya rutin dan pengeluaran pembangunan. Artinya untuk menambah biaya rutin dan pembangunan, pemerintah membuat utang baru. Untuk mengangsur utang lama dan bunga utang, pemerintah membuat utang baru.

Disini ada dua aspek berbahaya : utang baru selalu lebih besar dari angsuran utang lama. Akibatnya, utang kita terus meningkat. Kedua, utang baru pemerintah berbunga lebih tinggi (11 persen/tahun), berjangka lebih pendek (5-10 tahun), dan dari pasar modal. Bunga utang pada masa lalu amat rendah (1-3 persen/tahun), berjangka panjang (di atas 20 tahun), bersifat antarpemerintah, dalam skema bilateral atau multilateral.

Kita mengganti utang lama berbunga rendah (antara lain melunasi IMF) dengan utang baru berbunga tinggi, maka beban utang meningkat. Indonesia masuk perangkap utang dan ekonomi rentan guncangan eksternal. Dengan kondisi seperti ini, tepatkag menempatkan rasio utang terhadap PDB sebagai indikator untuk mengukur kekuatan ekonomi nasional ?

Tak relevan penjelasan Menteri Keuangan yang membandingkan situasi kita dengan Jepang mengingat Jepang memiliki kinerja ekonomi amat maju, aset produktifnya tersebar di seluruh dunia, utangnya dalam yen dan dari dalam negeri. GNP Indonesia lebih kecil dari PDB. Negara-negara berekonomi kuat, GNP-nya lebih besar dari PDB.

Menyadari ada kebutuhan berutang, mestinya IMF yang telah direformasi menjadi alternatif, bukan mengambil pinjaman berbunga tinggi. IMF menawarkan pinjaman non-conditional dengan bunga murah, hanya 2,0 persen/tahun. Meksiko telah memanfaatkan 47 miliar dollar AS. Brazil memakai dana IMF 35 milliar dollar AS, Korsel dan Singapura dalam antrean.

Amat berbeda karakter pinjam-meminjam antarnegara, yang lebih fleksibel dalam rescheduling dan berbunga rendah, dengan menjual obligasi ke pasar, risikonya amat besar. Taruhannya, rating seluruh dunia bisnis Indonesia.

Perkuat fondasi ekonomi

Beban Menteri Keuangan sungguh pelik mengingat sebagian masyarakat masih menganggap IMF seperti zaman Camdessus. Juga pelik antara keseimbangan menekan inflasi dan mengurangi defisit, meningkatkan pembangunan untuk memenuhi harapan rakyat, memperkuat rupiah dengan masuknya valas, termasuk dari utang, dan mempertahankan suku bunga agar sektor riil berkembang.

Maka, pemerintah perlu memperkuat fondasi ekonomi, memperkuat basis penerimaan negara. Penerimaan dalam negeri lewat pajak harus ditingkatkan sehingga lebih besar dari biaya rutin dan pembangunan, ada surplus untuk mengurangi utang. Ini hanya bisa dicapai bila kesejahteraan rakyat meningkat.

Situasinya berat karena tax ratio (rasio penerimaan pajak terhadap PDB) 2009 baru 13,8 persen. Tax ratio negara maju 40 persen dan Asia rata-rata 20 persen.

Pemikiran bahwa cicilan pokok dan bunga utang yang boleh dibayarkan dari APBN harus di bawah persentase tertentu dari penerimaan pajak, atau dari porsi nasional dalam ekonomi domestik, patut dipertimbangkan. Ini membuat kita jujur pada kemampuan membayar utang secara mandiri, dan tidak membayar utang dengan membuat utang baru sambil membiarkan banyak aspek pembangunan terbengkalai karena tidak ada dana, dan ekonomi nasional dikuasai asing.

Presiden SBY diharapkan mendengarkan aspirasi untuk mengurangi utang, selain mendengarkan suara yang menyatakan menambah utang tak apa-apa selama rasio terhadap PDB menurun.

Sumber  :

Menyimak Utang Negara – Siswono Yudo Husodo | Ketua Yayasan Universitas Pancasila
Kompas, 05.08.2009