Tags » Systems Biology

Non-minimum-phase dynamics in an inflammation model

Inflammation is the innate immune system’s response to tissue damage caused by trauma or infection. Thinking about it as the quickly receding rash after an insect bite detracts from the major antagonistic role it plays in medicine. 2,308 more words

Nature Echoes Nourish and Defend Behaviors on Many Scales

When our immune system sees a pathogen, something it perceives as harmful, it establishes ways to effectively neutralize or destroy that destructive agent. In doing this, it uses weapons (destructive agents), and vectors (vehicles) to carry the weapons it uses in defend to their appropriate location. 374 more words

Awareness

Biology Reveals Insights into Human Culture

This is an excellent documentary that illustrates how biological ecosystems find an equilibrium that is a suitable adaptive response to the environment. This means all the organisms that express nourishing and defense behaviors in a given ecosystem become specifically suited to the environment and each other. 193 more words

Life

How Smell Shapes Our Lives

There is no thing that we do on a macro scale that does not exist on a micro scale. Recurring echoes of self similarity with a blend of melodic dissonance is what makes up the magnificent symphony of structure we call biology. Smell is no exception:

Life

The Strategy Employed by Nature to get Things Done

When it comes to accomplishing tasks in the face of various forms of adversity and an environment that would need to be cultivated or persuaded to move toward a specific goal, one way of breaking down the various strategies that are possible to do this is a concept called destinationist. 187 more words

Wisdom

站在石器时代看我们自己——Cancer Biology 小结

关于癌症生物学,从大学以来我一直产生着大量的 perspectives,而且通过这一次系统的学习 The Biology of Cancer,我发现其实我对它的了解时刻都没有停止过。

从小的时候,身边的人因为肿瘤去世,我对它的理解就是——疾病。和其他的疾病一样,可以感染人体,对人体的正常机能造成影响。这种疾病,是一种绝症,因为没有药可以医治。即便是有,听说过的也就是剧毒的放疗和化疗。肿瘤转移这种复杂的词汇,我想大众都很清楚,因为此,很多时候外科手术无能为力治愈肿瘤。它就像是一个魔鬼,笼罩在人类的上空;它就像是一道门,将人类与更高的梦想分离。

之后开始接触到 The Biography of Cancer,这是第一次作为一个学生物的学生开始去了解人类认识和抗争肿瘤的历史。那个时候我对它的理解是,肿瘤这个疾病,和其他的不一样——它源自于我们自身,它是我们的进化,最终进化成为一种更加优于我们自己的存在,并最后将我们吞噬,或者说是取代。其中一些关键的历史节点——包括化疗的发现、放疗的发明、外科手术对肿瘤清除的理论,都让我觉得,人类与肿瘤的战争就好像是,我们一开始就认输了,只是想的是,怎么拖延一下,以防止全军覆灭。但是至少在那个年代,没有这些治疗方法,我们直接就是缴械投降,至少,我们开始了抵抗。

这将会是一场很长的斗争,因为决胜的东西在人类面前实在是太遥远,很多时候发现击败恶魔的东西,往往是来自于别处。就像是生命科学给肿瘤带来的曙光——发现 DNA 是遗传物质,发现蛋白质是重要的生命执行机器,发现肿瘤是程序错误的细胞,发现了癌基因和抑癌基因……尽管目前的游戏仍然没有翻转,但是这些发现,就像人类在阴雨雷暴笼罩的天空下,第一次看到了一丝阳光。

The Biology of Cancer 则进一步的从生命科学研究者的眼里,讲述了这段肿瘤生物学诞生的过程。这是一个非常庞大的故事,我就像是在阅读一部史书——名字叫,《人类肿瘤前史》。摸着石头过河的人类,第一次很奇妙的发现肿瘤病毒,曲曲折折的认识到肿瘤病毒对研究肿瘤竟然有不可思议的作用(原本大家认为人类的肿瘤都是有肿瘤病毒导致的,直到之后大家意识到不是如此;但尽管如此——由于肿瘤病毒中随机整合了宿主基因组的部分,导致肿瘤病毒致癌的片段很有可能是癌基因或者是抑制抑癌基因表达产物的编程程序)——事实上肿瘤病毒是我们打开真正认识肿瘤的开始。因为通过肿瘤病毒,我们开始了遗传筛选癌基因,建立了一套癌基因筛选方法和手段。并终于开始,能够直视这些导致细胞命运改变的错误程序指令——Src/Ras/PI3K/Raf/Myc……这些和肿瘤有关的错误指令的实际功能,在一些非常美妙的工作中,慢慢浮现——促进肿瘤生长、抑制肿瘤凋亡、逃逸免疫等等。

而阴阳两面的第二面,对抑癌基因的发现,也是源自于偶发性肿瘤和家族性肿瘤的出现,Rb/p53/NF1/pVHL/BRCA等等慢慢被人们意识到。这些精细的调控着细胞分裂、凋亡程序和基因组稳定性的家伙,是如何慢慢被时间磨灭,生锈,最后放过了这些错误细胞,并最后进入一发而不可收拾的状态。

这是经典肿瘤生物学最重要的两个部分,发现癌基因和抑癌基因,并清楚的了解他们在这个故事中所在的位置。这是第一次,我开始了解肿瘤细胞的程序。我有两个理解:
– 1)肿瘤确确实实是人类的进化,这种进化是随机的,但是通过选择这些细胞的生长具有优势性,从而体现出了肿瘤的人体环境的适应。但是我不再认为这是一种优于人类的存在,因为肿瘤的程序几乎没有和人类自身已经有的存在任何差异。
– 2)细胞信号通路、基因调控网络是一个非常庞大的存在,这就像是现实世界中的线路一样。但是此前我一直觉得这么庞大的网络,想要破坏它或者是极大地改变一个细胞的表型实在是很难的事情——肿瘤告诉我,不,只需要简单的改变一些,我们就可以实现这种巨大的改变。 117 more words

Science

Felicity Jones to play Ruth Bader Ginsburg in 'On the Basis of Sex'

Felicity Jones is going from a galaxy far, far away to the highest court in the land.

The Rogue One star is set to play Supreme Court Justice Ruth Bader Ginsburg in the biographical drama  120 more words

Movies